Fu fondata nel 1929 per la gestione dei giacimenti di apatite e nefelina dei monti Chibiny in Russia. Questo è uno dei giacimenti più grandi e più ricchi al mondo, principale risorsa di materie prime contenenti fosforo, unica per la sua compatibilità ambientale e purezza in Russia.
Nel corso degli anni la miniera ha fornito oltre 2 miliardi di tonnellate di minerale, ha prodotto oltre 700 milioni di tonnellate di concentrato di apatite e oltre 72 milioni di tonnellate di concentrato di nefelina.
JSC Apatit è il fiore all'occhiello la “sorgente” di PhosAgro, che fornisce alle strutture di produzione dell'azienda il concentrato di apatite naturale per la produzione dei fertilizzanti PhosAgro.
Oggi la Filiale di Kirovsk di JSC Apatit è la più grande impresa al mondo per la produzione di materie prime fosfatiche di alta qualità (con un contenuto di P2O5 del 37,5% circa) e l'unico produttore di concentrato di nefelina in Russia.
L'azienda gestisce sei giacimenti nella regione di Chibiny: Kukisvumchorr, Yukspor, Apatit Tsirk, Plateau Rasvumchorr, Koashva e Nyorkpakhk.
Nel 2018, negli stabilimenti di arricchimento sono stati prodotti 10,1 milioni di tonnellate di concentrato di apatite e 986 mila tonnellate di concentrato di nefelina.